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由于產卵場的破壞，圓口銅魚缺乏補充群體，圓口銅魚資源越捕越少，已成為偶獲種，而圓口銅魚由于其自身生物學特性，馴養難度大，研究仍停留于馴養和人工繁殖技術方面，保護壓力十分巨大。由于圓口銅魚資源有限，許多基礎研究無法開展。如圓口銅魚的性腺發育及調控技術、圓口銅魚主要疾病小瓜蟲病的入侵機理及防治方法等有待進一步深入研究。雖然突破了圓口銅魚的人工繁殖技術，但其苗種成活率極低。只有將人工繁殖魚苗培育成親魚、實現全人工繁殖后，才能實現圓口銅魚的物種保護。

1.

野生資源急劇下降：在金沙江部分江段漁獲物組成中圓口銅魚比例曾高達40%。然而,隨著金沙江、雅礱江和長江流域梯級水電的開發，其比例不斷降低。2011年向家壩截流后，其資源出現了明顯的下降，2013年溪洛渡水電站和官地電站建成后，其資源量更是急劇下降，圓口銅魚已經成為偶獲性物種。

2.

產卵場基本消失：圓口銅魚野生資源的下降與其產卵場的消失密不可分，捕獲的圓口銅魚均為庫區和河道中的殘留群體。四川省農業科學院水產研究所長期監測結果表明，圓口銅魚產卵場主要分布于金沙江下游和雅礱江下游。向家壩截流后，金沙江下游圓口銅魚產卵場完全消失，僅在金沙江攀枝花江段和雅礱江下游還殘存部分產卵場。2013年溪洛渡水電站和官地電站建成后，以及隨著白鶴灘和烏東德水電站的建設，這些殘存的產卵場已消失殆盡。從2015年開始，已經連續3年未監測到圓口銅魚產卵。可以基本斷定，圓口銅魚野生產卵場已經完全破壞。