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迄今為止，有關稀有鮈鯽的文獻有55篇，除關于分類和生物學研究的論文21篇以外，其余34篇都是稀有鮈鯽作為實驗魚應用的報道。據不完全統計，國內已有十幾個大學和科研單位使用稀有鮈鯽開展科學研究，這些工作涉及魚病學、遺傳學、環境科學、胚胎學、生理生態學等領域。在魚病學領域，王鐵輝等證實稀有鮈鯽對草魚出血病病毒異常敏感，可以將稀有鮈鯽作為草魚抗出血病病毒育種研究的模型。由于采用稀有鮈鯽作為研究材料，克服了采用草魚時個體大、世代周期長、繁殖期短、飼養與取材難等困難，從而大為加速了草魚抗出血病病毒育種研究的進程。

在環境科學領域，許多試驗證實，稀有鮈鯽對重金屬、農藥等化學品非常敏感，是進行化學品毒性測試和環境水樣毒性試驗的理想材料。周永欣等建立了稀有鮈鯽的5天和7天亞慢性毒性試驗模型。中國環境科學研究院不僅利用稀有鮈鯽進行了魚類毒性試驗，而且將稀有鮈鯽作為受試生物列入《國家環境保護局合格實驗室準則(1996)》和《水和廢水監測分析方法》（第四版）中。在二惡英的生態效應和早期預警研究方面，水生生物研究所的研究表明，稀有鮈鯽對2,3,7,8-TCDD極其敏感，低濃度下可致畸、致死、肝細胞受損。低濃度的2,3,7,8-TCDD即可誘導EROD酶活性，且酶的活性與暴露濃度有極好的劑量-效應關系，證明EROD生物測試法是一種快速、簡單、靈敏的生物方法，可作為生物標志物評價魚體不同發育階段的毒性效應和生物積累。目前，中國科學院水生生物研究所、中國科學院生態環境研究中心等正利用稀有鮈鯽為試驗材料在"評價內分泌干擾物長期低劑量暴露影響的魚類實驗模型"、"環境內分泌干擾物的生物篩選"等方面開展工作。

在遺傳學領域，已有研究者開展了染色體組操作、DNA含量測定、細胞色素b序列測定等方面的工作。此外，賈方均等進行了稀有鮈鯽人工雌核發育、人工雄核發育的研究，建立了稀有鮈鯽單性發育技術，為快速建立純系提供了一條新途徑。鐘家玉等用稀有鮈鯽作材料，優化了魚類電脈沖-精子介導轉基因方法。胡煒等通過異種核移植、連續核移植對魚類核質關系研究中的基礎問題進行了探討。由于魚類繁殖量大，體外受精、體外發育等特點，使進行轉基因、克隆等技術操作時較使用哺乳動物進行實驗方便許多，特別是稀有鮈鯽一年四季都可繁殖、且性成熟快，因而遺傳學研究的理想材料。

稀有鮈鯽(Gobiocypris rarus)隸屬于鯉形目鯉科，是我國特有的一種小型魚類，主要分布于四川省盆地西部邊緣，多棲息于稻田、溝渠、水洼等小型水體中。室養條件下稀有鮈鯽具有周年繁殖、性成熟快、產卵批次多、胚胎發育可人為控制等4大特點，再加上它具有單型種、溫度適應范圍廣、飼養管理方便、卵膜透明等一系列作為實驗魚的優點，是我國迄今發現的最適合作為實驗動物的魚類。從1990年開始，中國科學院水生生物研究所在其生物學背景、飼養管理技術、品系培育等方面開展了實驗動物化研究，并通過提供實驗魚、相關信息與技術支持等途徑推廣它在各個領域中的應用。“十二五”期間，我國將陸續研究制定稀有鮈鯽實驗動物質量和相關條件標準、檢測技術標準與規范以及多個毒性試驗國家環保標準，建立清潔級種群和資源保存基地。作為一種標準化的魚類實驗動物，稀有鮈鯽將在化學品測試、毒理學、遺傳學、疾病機理與藥物篩選等領域中得到更為廣泛的應用。